Kamuoyunda 4+4+4 kademeli eğitim yasası olarak bilinen 30 Mart 2012 tarihli 6287 sayılı "İlköğretim ve Eğitim Kanunu ile Bazı Kanunlarda Değişiklik Yapılmasına Dair Kanun"la birlikte açılan Ayvacık İmam Hatip Ortaokulu;

2012-2013 Eğitim - Öğretim yılında, 1 şube ile ilçemiz Mustafa Üstündağ Yatılı Bölge  Ortaokulu binasında açıldı.

2015-2016 Eğitim – Öğretim yılında kendi binasına taşınan okulumuz bu tarihten itibaren ilçemizde tek imam hatip ortaokulu olarak eğitim öğretim faaliyetine devam etmektedir.